Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL1Q99990 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms