Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms