Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

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Length 1,030 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMS19Q96T76 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMS19Q96T76 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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