Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CRBNQ96SW2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms