Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms