Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms