Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRAMP1Q96RY5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms