Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGS1Q96RS0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGS1Q96RS0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms