Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS4Q96RK4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS4Q96RK4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms