Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC4A9Q96Q91 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms