Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2CR12Q96Q35 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms