Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGLYRP2Q96PD5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms