Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMTD1Q96MG8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms