Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
JSRP1Q96MG2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms