Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRIMPOLQ96LW4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRIMPOLQ96LW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms