Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHACTR3Q96KR7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHACTR3Q96KR7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms