Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPGRIP1Q96KN7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms