Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR1Q96JP9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDHR1Q96JP9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms