Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms