Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CPNE2Q96FN4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CPNE2Q96FN4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms