Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC97Q96F63 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms