Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MVB12AQ96EY5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVB12AQ96EY5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms