Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD3Q96ES6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD3Q96ES6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD3Q96ES6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD3Q96ES6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD3Q96ES6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD3Q96ES6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms