Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
L3HYPDHQ96EM0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms