Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF21BQ96EK2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHF21BQ96EK2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.1 ms