Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDCCAG3Q96C92 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms