Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ROPN1LQ96C74 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ROPN1LQ96C74 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms