Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK4Q96C45 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 332.8 ms