Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VOPP1Q96AW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms