Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms