Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102AQ96A19 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102AQ96A19 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms