Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2E3Q969T4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3Q969T4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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