Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNX21Q969T3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX21Q969T3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms