Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TRIM63Q969Q1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM63Q969Q1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TRIM63Q969Q1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TRIM63Q969Q1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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TRIM63Q969Q1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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TRIM63Q969Q1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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TRIM63Q969Q1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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