Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFD1Q92890 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms