Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB13Q92826 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB13Q92826 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms