Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPC1Q8WXF1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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