Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCG3Q8WXD2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG3Q8WXD2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms