Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC12Q8WVT3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms