Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TRIM41Q8WV44 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC39.01■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC39■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRIM41Q8WV44 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRIM41Q8WV44 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms