Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSMCE1Q8WV22 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms