Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D1Q8WV19 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFT2D1Q8WV19 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms