Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSKUQ8WUA8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms