Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GIPC3Q8TF64 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GIPC3Q8TF64 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms