Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT2Q8TDY3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms