Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPBAR1Q8TDU6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms