Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA3Q8TBC4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBA3Q8TBC4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA3Q8TBC4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms