Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO27Q8NI29 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO27Q8NI29 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO27Q8NI29 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO27Q8NI29 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO27Q8NI29 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO27Q8NI29 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO27Q8NI29 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO27Q8NI29 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO27Q8NI29 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO27Q8NI29 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms