Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF397Q8NF99 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms