Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT1Q8NF37 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT1Q8NF37 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms